在创业板申请首次公开发行股票而未通过的企业共涉及持续盈利能力问题、规范运作问题、财务会计问题、独立性问题、主体资格问题、募集资金运用问题和信息披露问题这7大问题。
“创业板审核一直在加速。”深圳某券商一位保荐代表人告诉本报记者，“在加速的同时，企业的新问题开始浮现，PE腐败更是被频频强调。”所谓的PE腐败是指一些号称但并非真正PE的投资人士通过各种关系拿到上市前股权的投资机会。这些人可能知道证监会开始要审核项目，或知晓上市的时间表，然后通过各种关系以及各种运作拿到这些上市公司的投资额度，然后把额度加价卖给别人，或者自己持有。
另一问题是创业板企业的利润问题。“在早几批的优秀项目上市之后，如今的创业板项目企业利润明显偏低，在这之中，可能会出现企业调控近三年利润的手段出现。”一位保荐代表人分析。
涉及公司共17家，如深圳市方直科技股份有限公司、杭州正方软件股份有限公司、北京侏罗纪软件股份有限公司、杭州先临三维科技股份有限公司。
具体表现为：1,成长性欠缺。如上海奇想青晨化工科技股份有限公司最近3年实现净利润分别是2050万元、2402万元和2600万元，对应的同比增幅仅为17%、8%，企业2008年营业利润比2007年下降21.14%，营收也仅增长3.16%，且产品售价也呈现逐年下降之势。2,公司规模不足。如深圳市方直科技股份有限公司虽然最近3年成长速度较快，赢利能力大幅增强，但公司规模仍然较小，2009年底，总资产5904.58万元，股东权益5278.63万元。3,行业前景或经营环境发生重大变化。4,企业不符合创业板定位。如广东广机是一家招标采购服务商，一家没有任何核心技术且所处行业竞争高度激烈的公司。
拟上市公司主体是否独立、股权是否稳定、治理是否达标也是重要的考察内容。下面这些公司被否大多与上述原因有关：安得物流对美的集团存在大量关联交易，其高管也多由美的集团选派；从事保健品业务的航天生物需要借助控股股东的研发平台实现核心研发工作，主要研发人员也由后者研究人员兼职；同济同捷存在股权结构问题；三英焊业发行前实际控制人发生变化；银泰科技因和控股股东存在大量财务往来，被认为资金管理存在缺陷。
保荐机构应重点推荐符合国家战略性新兴产业发展方向的企业，特别是新能源、新材料、信息、生物与新医药、节能环保、航空航天、海洋、先进制造、高技术服务等领域的企业，以及其他领域中具有自主创新能力、成长性强的企业。
保荐机构推荐下列领域的企业，应当就该企业是否符合创业板定位履行严格的核查论证程序，并在发行保荐书和保荐工作报告中说明论证过程和论证结论，尤其应当重点论述企业在技术和业务模式方面是否具有突出的自主创新能力，是否有利于促进产业结构调整和技术升级：(一)纺织、服装;(二)电力、煤气及水的生产供应等公用事业;(三)房地产开发与经营，土木工程建筑;(四)交通运输;(五)酒类、食品、饮料;(六)金融;(七)一般性服务业;(八)国家产业政策明确抑制的产能过剩和重复建设的行业。
保荐机构选择、推荐创业板企业，应当重点关注企业的创新能力，深入核查企业是否拥有关键的核心技术、突出的研发优势、创新的业务模式以及较强的市场开拓能力，并在成长性专项意见中予以说明。[详情]
如深圳市方直科技股份有限公司、杭州正方软件股份有限公司、北京侏罗纪软件股份有限公司、杭州先临三维科技股份有限公司
如北京福星晓程电子科技股份有限公司、江西恒大高新技术股份有限公司、北京易讯无限信息技术股份有限公司、上海金仕达卫宁软件股份有限公司
如南京磐能电力科技股份有限公司、上海同济同捷科技股份有限公司、江西恒大高新技术股份有限公司、天津三英焊业股份有限公司
如安徽桑乐金股份有限公司、武汉银泰科技电源股份有限公司、深圳海联讯科技股份有限公司、上海麦杰科技股份有限公司
如深圳市卓宝科技股份有限公司、上海开能环保设备股份有限公司、苏州恒久光电、广东广机国际招标股份有限公司
如上海奇想青晨化工科技股份有限公司、赛轮股份有限公司、北京博晖创新光电技术股份有限公司、广东冠昊生物科技股份有限公司