转自:诺唯赞生物
转录因子CUT&Tag,不得不说的“伤痛”
转录因子是一类特殊的蛋白质,通过与DNA特定序列结合,调控基因转录过程。CUT&Tag可以在活细胞中检测全基因组范围内转录因子的结合位点,是研究转录因子调控机制的利器。
但“高速运转”的细胞动态发生着转录翻译的生命活动,由于转录因子与基因组的结合具有动态或间接的特点,并非一直牢牢地结合在DNA上,因此时常出现转录因子CUT&Tag文库产出低、TSS富集差,IGV信噪比低的情况,让科研人员深受困扰。
诺唯赞 TF enhancer——转录因子“救星”
如何从源头解决难题?有效策略是提升转录因子与基因组的结合强度以及降低背景信号干扰。诺唯赞全新推出适配各种低丰度靶点的表观遗传工具-TF enhancer,该技术能有效提升转录因子(TF)信噪比——采用抗原信号暴露,非靶点封闭以及蛋白核酸固定技术,确保获取高信噪比的转录因子和转录因子复合物数据。该方案通过优化反应条件和设计独特试剂,实现了对高、中、低丰度转录因子的高灵敏度检测,同时有效降低了非特异性背景信号,不会造成IgG的TSS富集效应,大大减少假阳性,数据真实可靠。
*(敲黑板!!!)搭配诺唯赞CUT&Tag试剂盒Pro(Vazyme #TD904)效果更佳!
产品亮点
检测微弱信号更容易
阴性对照IgG无显著富集
适合高、中、低丰度转录因子
性能展示
✔ 诺唯赞 TF enhancer不会引起假阳性
投入100,000 个Hela细胞,一抗添加IgG(CST #2729)作为阴性对照,采用不同的交联方式,并进行CUT&Tag全流程实验。结果发现,细胞用0.5%甲醛交联后,阴性对照在TSS和部分基因位点富集显著(图1、2),而使用TF enhancer(Vazyme #TD904-C2)处理细胞时,阴性对照在TSS和IGV上的富集情况与未交联的细胞结果类似,没有显著增加富集信号,保证了数据的真实性。
唯赞 TF enhancer;C)不交联。
0.5% Methanal_IgG:0.5%甲醛交联细胞;
TD904-C2_IgG:诺唯赞 TF enhancer处理;
Normal IgG:未交联的细胞。
✔ 兼容不同丰度转录因子
投入100,000个Hela细胞,在不同丰度的转录因子上,诺唯赞 TF enhancer(Vazyme #TD904-C2)能够显著提升TSS富集和IGV视图信噪比,且不造成阴性对照IgG的信号富集,实现了对高、中、低丰度转录因子的高灵敏度真实信号检测(图3、4)。
TD904-C2表示TF enhancer处理样本,Normal表示未处理样本
图4.1-4.4 转录因子Vazyme TF enhancer前后IGV视图对比TD904-C2表示Vazyme TF enhancer处理样本,Normal表示未处理样本。
免费试用
想要突破转录因子CUT&Tag难关?快来试试诺唯赞为转录因子CUT&Tag量身定制的Vazyme TF enhancer模块(Vazyme #TD904-C2)!
(转自:诺唯赞生物)
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