中科院深圳理工大学潘毅:人工智能赋能生物医药,使生物学家少走弯路

中科院深圳理工大学潘毅:人工智能赋能生物医药,使生物学家少走弯路
2022年11月17日 22:17 市场资讯

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  11月15日-17日,第二十四届中国国际高新技术成果交易会-中国高新技术论坛在深圳召开,主题为:科技改革驱动创新,科技创新驱动发展。中国科学院深圳理工大学(筹)计算机科学与控制工程学院院长、乌克兰国家工程院外籍院士、美国医学与生物工程院院士、英国皇家公共卫生学院院士潘毅出席论坛并演讲。

  如何做人工智能制药?潘毅表示,主要用四种数据库:一是药物数据库、二是蛋白质基因数据库、三是疾病数据库,四是集成数据库。

  具体到应用方面,药物的生产流程有药物发现、临床前研究、临床实验最后上市,具体的应用首先要发现靶点,随后是药理的评估,还有重定位、药物组合等,最后是审批。AI的技术应到深度学习、语言处理、强化学习等,很多科学家已经在用这些技术了。

  比如说药物靶点的发现,用AI已经实现了。除了靶点以外,AI已经很准确预测到蛋白质的3D结构了,也预测到了药的副作用。

  他表示,要把知识跟数据合起来。既有知识放进去,也要有数据上的归纳能力,能做到举十反一。

  他分享了几个案例:第一个是用人工智能计算出蛋白质跟靶标、小分子耦合度多近。“我们用了三个小分子药物数据库,用了8888个小分子,通过深度学习以后,发现他们是比较紧密的,筛选到421个,筛选出来以后我们再做specificity  checking叫做专有,检查后变成69个了,我们做了五个实验,两个红的找到了,实验里面确定非常紧密,可能能做成药,这个故事讲的是什么意思?我们用人工智能正向反向找,刚开始你给我8888个小分子,这个小分子都在药库里面,都已经是现成的药,我们用人工智能筛选到421个再筛选以后变成69,用分子动力学再筛选变成69个,最后变成五个以后,实验有两个比较成功,就是说我们的AI技术很有用,五个里面找到两个,假如说没有AI我们要8888个都要试一遍才能有两个或者五个,这样我们就省钱了。”

  第二个故事,药物的重定位。“假如说现在阿司匹林被用来治疗感冒、降温,但是阿司匹林最近找到新的应用,有时候血压高或者有堵塞用阿司匹林把血通上,吸了以后可以流通,血梗就少了。药物重定位很有用,这个药在人体上作用,新药可能把新的病治好,但是新药有副作用,两年吃这个药不知道,20年后有副作用已经晚了。旧药大家知道这个病可以治好,别的副作用没有发现,假如说你把这个旧药发现一个新的可以治病的东西就好了,因为副作用少了,也还省钱,因为流程已经做好了,怎么找到旧药新用是一个问题。”

  计算药物重新定位怎么做?他表示,要去挖掘这两个药之间有没有关联,这个药和病、靶标有没有关联。利用关联网发现旧药新用,发现关联就找到新的方案,这些都是人工智能需要做的工作。人工智能做了什么工作?筛选药物使得生物学家可以少走弯路有定向的指标达到好的效果。

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责任编辑:李昂

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