转自:优宁维抗体专家
哇塞
为了评估CRISPR系统的编辑效率,一般会在96孔板中培养细胞,用于基因分型验证,大量的DNA纯化工作即将到来......
小优经过调查,发现各位科研工作者们都在使用一种快速且高效的细胞DNA提取试剂,据说一个96孔板的DNA提取只要15min!
准备好了嘛?一起进入快速提取的新时代!
prepGEM Universal DNA提取是低数量细胞的理想选择,仅需15min即可纯化得到细胞DNA。
01
样本制备
1. 悬浮细胞:将承载细胞的整个载体放在离心机中,200RCF离心5min,去除掉培养基等液体,将细胞重悬在prepGEM试剂中。
2. 贴壁细胞:如果细胞在培养瓶中,首选的方法(胰蛋白酶或细胞刮板)消化细胞,200RCF离心5分钟。或可以将prepGEM提取液直接添加到细胞中;去除掉培养基等液体,将细胞重悬在prepGEM试剂中。
*prepGEM试剂对EDTA和其他螯合剂敏感。如果细胞呈现在含有edta的溶液中(如用于分离贴壁细胞的胰蛋白酶-edta),应在200 RCF离心,提取前在1X BLUE buffer中洗涤。
02
DNA提取流程
1. prepGEM适用于广泛的细胞数量,5-10w个细胞产量具有线性化,针对不同的细胞数量,添加的试剂盒终体积均有不同,请按照下表的细胞数量添加对应buffer。
2. 涡旋后放入PCR仪或其他加热模块中加热。
- | Cell Numbers Pellet | Time |
75℃ | >50,000 cells | 10min |
1000-50000 cells | 5min | |
<1000 cells | 2min | |
95℃ | 5min |
3. 样本完成以上程序即可进行下游使用。
4. 如需要保存,将DNA保存在-20℃。
03
PrepGEM试剂的流程看起来很简单,
除此之外还有什么优势呢?
●15min完成DNA纯化
● 无抑制剂的试剂意味着没有苛刻的化学清洗或多个步骤
● 单管提取可以保证样本的完整性
● 简化的工作流程节省了准备时间,降低了实验室成本,并显著减少了危险废物和塑料废物对环境的影响
Reference
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3. Zhang Y, Schmid B, Nielse TT, Neilse JE, Clausen C, Hyttel P, Holst B, Freude KK (2016) Generation of a human-induced pluripotent stem cell line
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5. Yang L, Grishin D, Wang G, Aach J, Zhang C, Chari R, Homsy J, Cai X, Zhao Y, Fan J, Seidman C, Seidman J, Pu W, Church G (2014) Targeted and genome-wide sequencing reveal single nucleotide variations impacting specificity of Cas9 in human stem cells. Nature Communications
5:5507, https://doi.org/10.1038/ncomms6507.
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