科学家构建环境响应型自组装蛋白质球支架,为构建智能化细胞工厂奠定基础

科学家构建环境响应型自组装蛋白质球支架,为构建智能化细胞工厂奠定基础
2024年06月11日 16:21 DeepTech深科技

来源:DeepTech深科技

自组装蛋白质球支架可以以纳米精度精确控制酶分子距离、化学计量比、空间分布等酶催化关键参数,从根本上解决细胞工厂内酶分子空间排布紊乱的科学难题,提升细胞工厂的生物催化效率,为绿色生物制造提供优质分子工具、人工细胞器和优良菌株。

细胞直径通常在数微米大小,只有头发丝直径的几十分之一大小。在如此狭小的空间内,同时有成千上万的化学反应在发生。

更令人惊叹的是,如此众多的反应不仅能有条不紊地进行,并且能针对内外环境的改变做出及时调整。

细胞之所以能完成上述看似不可能完成的任务,在于经过进化打磨之后的细胞拥有多酶代谢区室。

多酶代谢区室,指的是催化顺序反应的酶分子通过相互作用形成的多酶复合物。

多酶复合物的形成,能够加速中间代谢产物在酶分子间的传递、抑制竞争反应、防止有毒代谢产物的积累。

并且,天然多酶复合物还能通过自身的组装状态,来调控代谢反应。例如,高粱的抗虫害机制就与多酶复合物密切相关。

蜀黍苷,则是一种抗昆虫的氰类化合物,蜀黍苷的生物合成由若干个 P450 酶完成。

当这些 P450 酶分子组装成为多酶复合物时会合成蜀黍苷。然而,当多酶复合物解离成为游离的酶分子时,这一系列酶分子则会合成抗真菌的醛肟类化合物。

也就是说,多酶复合物——是细胞在空间层面调控酶促反应、进而让生物化学反应变得井然有序的重要手段。

生物制造,是以工业生物技术为核心,利用酶、微生物细胞、结合化学工程技术进行目标产品的加工过程,包括生物基材料、化学品和生物能源等。

生物制造的核心是“菌株细胞”。然而,由于缺乏进化的打磨,导致生物制造缺乏天然细胞那样的动态多酶复合物。

对于人工构建的代谢通路中的酶分子来说,其在细胞内呈现出无序排布的状态,这会造成中间代谢产物流失、以及催化效率低下。

针对上述问题,大连理工大学薛闯教授和团队,此前曾构建出一种自组装蛋白质支架。

在这种蛋白支架的帮助之下,能够以纳米级别的精度,针对酶分子进行空间组织,进而形成多酶复合物,借此提高人工改造菌株的催化性能。

他们发现这些组装的多酶系统的比生产率,比未组装的系统高出八倍。

然而,利用这种蛋白支架构建的多酶复合物,由于是静态的多酶复合物,因此缺乏类似于天然多酶复合物那种响应内外界环境的能力。

(来源:JACS)(来源:JACS

所以,课题组十分期待能够通过仿生手段,来构建动态的多酶复合物,从而让人工改造细胞拥有像天然细胞一样的鲁棒性和环境适应性。

在最近一项研究中,该团队结合光遗传学工具和化学遗传学工具,构建了可以响应外界环境的自组装蛋白质球支架。

(来源:JACS)(来源:JACS

总的来说,本次提出的分子支架不仅能够以可控的方式来招募酶分子,并能组装可逆的动态多酶复合物。

事实上,只要是蛋白质分子,本次分子支架都能做到可控的释放和招募。

目前,他们正在利用本次蛋白质分子支架开发药物靶向递送和释放系统。

另外,在基因编辑领域,如何实现动态和实时的基因编辑,也是一大研究热点。

因此,他们也将尝试利用本次分子支架,力争实现基因编辑系统的动态调控。

参考资料:

1.Kang, W., Ma, X., Zhang, H., Ma, J., Liu, C., Li, J., ... & Xue, C. (2024). Dynamic Metabolons Using Stimuli-Responsive Protein Cages.Journal of the American Chemical Society.

运营/排版:何晨龙

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