“小柯”秀

《自然-生物技术》

双向表观遗传编辑揭示基因调控层次结构

美国斯坦福大学Howard Y. Chang小组发现,双向表观遗传编辑能够揭示基因调控的层次结构。该研究成果近日在线发表于《自然-生物技术》。

研究人员开发了一种名为CRISPRai的双向表观遗传编辑系统。在该系统中,研究人员对同一细胞中的两个位点同时施加激活(CRISPRa)和抑制(CRISPRi)扰动。研究人员开发了CRISPRai Perturb-seq,将双扰动gRNA检测与单细胞RNA测序结合起来,从而能够研究混合单细胞群体中的集合扰动。研究人员应用这一平台研究了两种造血系转录因子SPI1和GATA1之间的遗传相互作用,发现了它们对下游靶基因共同调控的新特点,包括SPI1和GATA1在通过不同模式调控的基因上的占有率差异。

研究人员还揭示了Jurkat T细胞、原代T细胞和嵌合抗原受体(CAR)T细胞中IL2(白细胞介素-2)的调控图谱,并阐明了增强子介导的IL2基因调控机制。CRISPRai Perturb-seq有助于研究特定环境下的基因相互作用,为基因调控提供了新见解,并将有助于探索非编码疾病相关变体。

据悉,CRISPR扰动方法在研究非编码元件和基因相互作用方面能力有限。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1038/s41587-024-02213-3

基因小柯
新浪科技公众号
新浪科技公众号

“掌”握科技鲜闻 (微信搜索techsina或扫描左侧二维码关注)

创事记

科学探索

科学大家

苹果汇

众测

专题

官方微博

新浪科技 新浪数码 新浪手机 科学探索 苹果汇 新浪众测

公众号

新浪科技

新浪科技为你带来最新鲜的科技资讯

苹果汇

苹果汇为你带来最新鲜的苹果产品新闻

新浪众测

新酷产品第一时间免费试玩

新浪探索

提供最新的科学家新闻,精彩的震撼图片