一个能发现药物的AI?日本三井携手英伟达打造Tokyo-1项目

一个能发现药物的AI?日本三井携手英伟达打造Tokyo-1项目
2023年03月22日 14:44 财联社

财联社3月22日讯(编辑 马兰)昨日的英伟达春季GTC大会给不少人带去了新的思考。其首席执行官黄仁勋表示,整个人工智能产业正处于“iPhone时刻”,创业公司竞相颠覆旧有的商业模式,业界巨头也在积极回应这一变化。

而在英伟达人工智能领域的一众进展中,其与日本集团三井物产的合作又为人工智能开辟了新的赛道。

据英伟达称,其将与三井物产株式会社(Mitsui)就Tokyo-1项目展开合作,旨在通过高分辨率分子动力学模拟和用于药物发现的生成式人工智能(AIGC)模型等技术,来提高日本制药实力。

Tokyo-1项目依赖于英伟达的DGX AI超级计算机,项目中客户将拥有英伟达DGX H100节点的访问权限,可以进行分子动力学模拟、大型语言模型训练、量子化学、生成AI模型以创造药物的新分子结构等操作。

此外,Tokyo-1还可提供英伟达BioNeMo软件,利用包括化学、蛋白质、DNA和RNA数据在内的大型语言模型,来帮助用户发现药物。

日本的制药公司和初创公司预计都可以参加Tokyo-1项目,三井物产子公司Xeureka将负责运营Tokyo-1,并在今年晚些时候正式上线这一项目。同时,计算和人工智能药物相关的研讨会及培训也会陆续排上日程。

日本冲击制药领导者

据三井物产数字医疗业务部总经理Yuhi Abe称,日本制药公司是湿实验研究的专家,但一直未能大规模利用高性能计算工具和人工智能,进入干实验。通过Tokyo-1,三井物产正在创建一个创新中心,使制药行业能够快速进步。

干实验是通过计算机模拟以及生物信息学方法来进行研究。湿实验则较为传统,是指通过采用分子、细胞、生理学试验方法进行研究。

英伟达的入局有望加速日本价值1000亿美元的制药业发展,目前为止,日本是继美国和中国之后的全球第三大制药国。

Abe补充称,日本制药业长期以来一直面临药物研发滞后的问题,药物开发和批准均较其他地方有所延误。而在新冠疫情时的疫苗竞赛中,这一问题正被不断放大。

这也是三井物产大费周章发展人工智能的一个关键因素。

Xeureka科技部门产品工程师经理Hiroki Makiguchi称,Tokyo-1旨在解决日本实施数据驱动、药物发现上一些障碍,通过高性能计算提升日本制药业的水平,并释放生成式人工智能发现新药物和新疗法的潜力。

通过在Tokyo-1超级计算机上使用英伟达BioNeMo软件,研究人员将能够通过模型运行和分析数百万甚至数十亿个参数,以此进行蛋白质结构预测、小分子生成和姿态预测(pose prediction estimation)等操作。

日本医疗界正摩拳擦掌

日本主要制药公司,包括Astellas Pharma、Daiichi-Sankyo和Ono Pharmaceutical都已经透露将参与Tokyo-1项目。

Astellas称将以创新的数字解决方案,最大限度地提高患者的治疗效果和降低医疗成本。

该公司的数字研究解决方案、高级信息学和mRNA医学负责人Kazuhisa Tsunoyama表示,人工智能和大数据模拟可用于小分子化合物、抗体、基因治疗、细胞治疗、靶向蛋白质降解、工程噬菌体治疗和mRNA医学等应用。

Daiichi-Sankyo则透露,将使用Tokyo-1建立一个集成人工智能和机器学习的药物发现过程。

其高级研究员Takayuki Serizawa称,利用尖端GPU资源,其将能够执行大规模计算以加速药物发现工作,这将改善药物输送并实现个性化医疗。

Oho Pharmaceutical则专注于肿瘤学、免疫学和神经学领域的药物发现。该公司认为英伟达的DGX超级计算机用途十分广泛,能完成包括高质量模拟、图像分析、视频分析和构建语言模型等任务。

除了制药行业,三井还计划联合日本的医疗设备公司和初创公司,并将Tokyo-1的客户连接到英伟达Inception计划,与全球医疗初创公司共同研究如何利用人工智能加速行业发展。

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