由于《意见》惠农政策覆盖面广，因此，相关涉农上市公司的龙头企业尤其值得关注。《意见》指出，要进一步增加对种粮农民直接补贴、加大良种补贴力度，实现水稻、小麦、玉米、棉花全覆盖；继续提高粮食最低收购价，优化品种结构，提高单产水平，扩大国家粮食、棉花、食用植物油、猪肉储备；适时启动主要农产品临时收储，鼓励企业增加商业收储；继续落实生猪良种补贴和能繁母猪补贴政策等等。这些政策将对抑制农产品价格下行、增加市场对良种需求产生积极的影响。

　　据兴业证券测算，为了推动粮食增产、农民增收，国家将继续加大农业补贴力度，包括良种补贴、粮食直补、农机具购置补贴、农资综合补贴。2008年补贴总额为1028亿元，预计2009年将增加10%以上，有望达到1200亿元。智多盈投资余凯认为，北大荒、新农开发、新赛股份、福成五丰、隆平高科、登海种业等将直接受益。

　　业内分析人士认为，在惠农政策利好的刺激下，农业板块将形成三大主题投资机会：

　　一是生产型企业直接受益。《意见》指出，要加快发展畜牧水产规模化标准化健康养殖，加大畜禽水产良种工程实施力度，充实动物防疫体系建设内容，加快推进动物标识及疫病可追溯体系建设，这将给通威股份、新希望、远望谷、新大陆、中牧股份、金宇集团等相关企业提供新的发展空间。“支持优势产区发展糖料、马铃薯、天然橡胶等作物”的政策，对亚盛集团、南宁糖业、贵糖股份等公司而言则面临着新的发展机遇。

　　二是规模农业带来的机会。《意见》指出要建立健全土地承包经营权流转市场，一场“新土改”随着中央允许农民流转土地承包经营权而拉开帷幕，这意味着土地以转包、出租、互换、转让或股份合作等形式实现“适度规模经营”。这无疑将彻底打破原有的粗放式经营模式，有利于建立规模农业，实现农业生产的集约化、现代化，大大提高农业生产的效率。这一过程将为高科技农业、技术含量较高的高产种子、无毒化肥、生物农药、节水灌溉等支农产品和技术将面临更加广阔的市场。例如，隆平高科、登海种业、扬农化工、新安股份等面临着新的发展机会。

　　三是资源价值面临重估。同样得益于农村土地经营权的自由流转，具有较多土地、林地、水域等资源的上市公司将面临极大的价值重估机遇。有代表性的主要有北大荒、新农开发、新赛股份、獐子岛、好当家、洞庭水殖、绿大地等。而全面推进集体林权制度改革以及对农民承包权力的确认，使诸如吉林森工、永安林业、洞庭水殖等拥有林地、水域等资源性资产的上市公司更值得长期关注。另外，在农产品加工、养殖领域中，像好当家、天宝股份、中粮屯河等子行业龙头值得关注。

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