2005年，掀起医疗改革大震荡的是国务院发展研究中心，《中国青年报》报道称，国研中心的研究报告得出了一个惊人的结论：中国医改不成功。

　　随后，最终增至16个部委的医改协调小组成立。来自中外的八个非官方医改小组陆续接受政府委托，建立了八套医疗改革方案。在征求意见稿出台后，社科院的建议稿也交到了相关部委。

　　这些医改的非官方参与者被简单地划分为市场派和政府派，而最先树立旗帜的还是卫生部。

　　2005年5月，时任卫生部副部长马晓华强调“医改应该政府主导”，随后，卫生部下属的一份报纸又撰文称，“市场化非医改方向”。此后，医疗体制改革的政府派和市场派的争论一直未消停。

　　在余晖看来，简单的划分“政府派”和“市场派”并不十分科学。他的理由是，“虽然我们被称为市场派，其实我们也强调政府加强对医药行业的监管和增加对城市居民、新农合以及医疗救助的投入，发挥公立医疗保险的作用，通过付费机制的完善更有效地购买各种医疗机构的服务。”

　　不过，余晖觉得，最为珍贵的是，“大家有机会对医改畅所欲言”。 就是这一波的医疗改革，被余晖认为具有“准公共政策过程的性质”。

　　“前几次医改，话语权掌握在政府手里，这一次是广开言路。”

　　最广泛的言路渠道在10月14日开通，涉及每个国人利益的医改征求意见稿公布，“每个人都可以提意见”。截至意见征求期间结束，共有35260条意见摆放在了相关部委的办公桌上。

　　“我们就等尘埃落定吧，现在最重要的就是医改方案由谁来评估，按什么标准来评估。”他的预测是，最终的医改方案可能最晚会在明年两会前出台。