新华龙钼业招股书显示，公司2009年、2010年及2011年上半年综合毛利率水平仅分别为6.85%、6.26%及5.89%。主营业务同为钼及其相关产品的金钼股份，2009年、2010年及2011年上半年综合毛利率水平分别达19.20%、18.77% 及17.36%；洛阳钼业更是分别高达27.25%、36.33%及32.04%。
    从数值对比可以看出，过去几年里，金钼股份的综合毛利率是新华龙钼业的三倍，而洛阳钼业的综合毛利率水平甚至高出新华龙钼业近五倍。
    新华龙钼业利润与同类企业相比较低主要原因在于其缺乏上游钼矿资源。新华龙钼业2009年、2010年和2011年钼精矿采购量分别为：4851.72吨、16336.52吨和24123.31吨，公司钼精矿原材料的外购比例为100%。
    其目前仅拥有吉林省安图县双山钼铜多金属矿的采矿权、吉林省安图县双山地区金、多金属矿普查项目的探矿权及吉林省和龙市石马洞地区钼、多金属矿普查项目的探矿权。其中吉林省安图县双山钼铜多金属矿床通过评审的钼资源储量(金属量)3.89万吨，远低于上述同类企业。
    新华龙钼业招股书显示，2009年12月31日、2010年12月31日和2011年12月31日，公司母公司口径的资产负债率分别为68.41%、65.75%和66.11%。报告期内，新华龙钼业的资产负债率较高，主要是为满足日常原料采购的需要，短期借款及应付账款的金额均维持在较高的水平，公司也正努力改变以短期借款为主的资产负债结构，但依然存在一定的财务风险。
    另外，新华龙钼业在2009年至2011年中应收账款的净额分别为7688.82万元、15064.61万元和16323.22万元，占当期营业收入的比例分别为4.48%、4.97%和4.84%。虽然公司的应收账款占公司营业收入的比例较小，但绝对金额较大，不排除因市场环境发生重大变化产生坏账的风险。 在负债率、应收账款、坏账金额三方面均处于高位情况下，新华龙钼业已面临较高的财务风险。

    新华龙钼业的招股书显示，公司董事长郭光华直接持有公司40.19%的股份，且持有新华龙集团52.61%的股份(新华龙集团持有公司26.32%的股份)，郭光华的夫人秦丽婧直接持有公司9.75%的股份。郭氏夫妇直接持有公司49.94%的股份，且通过新华龙集团间接持有公司26.32%的股份，因而实际控制公司表决权股份76.26%。
    郭光华与秦丽婧的亲属共计持有新华龙钼业12.79%股份，加上郭氏夫妇直接和间接持有的76.26%股份，郭氏家族持有新华龙钼业的89.05%的股权，可谓一股独大。
    另外，颇受投资者关注的是萦绕在公司董事长郭光华头顶的“政府背景”光环。据该公司网站的新闻报道，郭光华于2011年1月7日当选凌海市第四届人大常委会副主任(注：凌海市为锦州市辖区之县级市)。
    尽管目前我国的《公司法》尚且没有明文禁止公务员从事商业活动，但是公务员法和中组部廉政准则均明确规定公务员尤其是党员干部禁止从事营利性活动。《中华人民共和国公务员法》第五十三条规定，公务员不得从事或者参与营利性活动、在企业或者其他营利性组织中兼任职务。
    对此疑问，新华龙钼业证券事务部工作人员的回答为“人大副主任不属于国家公务员序列”。但在《公务员法》界定的七类工作人员中人大代表大会机构之工作人员位列第二种。记者与多位各级别公务员沟通，均认为各级人大常务委员会作为各级权力机构的常设机构代为行使权力，“副主任”不属于公务员实属牵强，或者存在“地方特殊情况”。

    “钼制品产能建设定位于技术含量高、附加值高、未来发展前景良好的钼制品市场，有助于改善公司的产品结构，提高公司盈利能力。钼精矿选厂的建设，有助于提高公司在原材料方面的自给能力，充分发挥公司已取得的采矿权的效益，增强抵御原材料价格市场波动的风险。预计项目全部达产后，公司每年新增销售收入约46366.08万元，新增净利润6722.73万元。”新华龙钼业在招股书中如此描述了募投项目的美好前景。
    对此，有业内人士表示，有色金属刚经历了一轮牛市，目前钼精矿每吨9万元左右的价格并非处于历史低位，而新华龙钼业“本着审慎的态度”制定的每吨13.93万元募投项目的价格预测标准过于乐观。
    对行业来说，目前宏观经济形势不明朗，下游房地产调控进一步加大力度，汽车产业增长趋缓。因此，新华龙钼业募投项目价格预测应该审慎的态度是以算术平均价与现在的市场价格孰低为基础。如果按9万元/吨左右的价格来预测，不知募投项目还是否值得投资？
    此外，新华龙钼业的矿产资源能否形成稳定的产能也是市场质疑点。业内人士指出，对于矿产资源形成稳定的产能，是个漫长的过程。对于新进入的企业来讲，需要拥有技术储备、有经验的团队以及大量的资金投入。对于新华龙钼业来说，其或存在不小的困难。