破译枸杞子基因组图谱

破译枸杞子基因组图谱
2024年12月12日 06:51 中国科学报
张行勇/摄张行勇/摄

本报讯(记者孟凌霄)中国科学院生物物理研究所陈润生院士团队联合陈畅研究员团队,解析了枸杞基因组图谱及活性成分,首次揭示了枸杞果胶多糖(LBPPs)的完整生物合成途径,并鉴定了关键合成酶及与糖代谢调控相关的RNA。相关论文近日发表于《基因组学、蛋白质组学和生物信息学》。

LBPPs是枸杞的主要生物活性成分,具有抗氧化、免疫调节、抗衰老等多种功效。尽管枸杞在健康领域应用较多,但由于缺少精确的遗传图谱,人们对LBPPs合成过程和调控机制的研究有限,这在很大程度上制约了枸杞分子育种的发展及国际推广。

该研究基于三代测序技术、光学图谱技术、自研高效三维基因组捕获技术等方法,对枸杞基因组进行从头组装,突破枸杞基因组高杂合、高重复的瓶颈,获得了枸杞高精度基因组图谱。在此基础上,研究人员解析了多糖活性酶基因库CAZymes在LBPPs合成中的核心作用,尤其是在LBPPs骨架延伸、侧链合成和链修饰等方面的累积扩张。研究进一步鉴定了一个关键鼠李糖糖基转移酶基因RRT3020,其能够显著促进LBPPs生成。此外,该研究初次解析了与LBPPs代谢相关的长链非编码RNA,为深入了解基因调控提供了新视角。

相关论文信息:https://doi.org/10.1093/gpbjnl/qzae079

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