一家美国公司宣布基本完成灭绝袋狼基因组测序

一家美国公司宣布基本完成灭绝袋狼基因组测序
2024年10月21日 06:50 中国科学报

本报讯 近日,致力于复活灭绝物种的美国公司Colossal宣布,已经完成超过99.9%的灭绝袋狼基因组测序,仅剩45个空缺有待填补。不过,该公司并未提供任何证据支持这一说法。

袋狼又被称作塔斯马尼亚虎,是一种曾广泛分布于澳大利亚的肉食性有袋动物,但欧洲探险家抵达时,它们的栖息地仅限于塔斯马尼亚岛。最后一只袋狼1936年死于动物园。

2017年,研究人员首次对108年前保存于酒精中的袋狼育儿袋组织进行了基因组测序。然而,该基因组并不完整,存在许多空白。

“获取任何生物的完整基因组都相当困难。”丹麦哥本哈根大学的Emilio Mármol-Sánchez说,她的团队最早从保存的袋狼样本中提取了RNA。

现在,Colossal表示,借助一颗保存了120年的牙齿中的DNA,他们基本完成了袋狼的基因组测序。

“我们获得的袋狼基因组并不像人类基因组那样完整,但能够利用一些相同的技术。”Colossal科学顾问委员会成员、澳大利亚墨尔本大学表观遗传学教授Andrew Pask说,完全测序植物和动物基因组很难,因为有很大一部分相同序列被重复了很多次。标准测序技术一次只能处理小片段的DNA,更新的长读技术可以测序更大的DNA片段。然而,古老的DNA通常会分解成许多小片段,因此这些方法往往不起作用。

“大多数古老样本保存的DNA片段长度大约为几十个碱基,幸运的话可能有几百个。我们获得的样本保存得非常完好,以至于我们能够恢复几千个碱基的DNA片段。”Pask说。

由于缺乏其他可以比较的袋狼基因组,因此目前没有直接判断基因组完整性的方法。Pask表示,Colossal正在使用同一科的其他相关物种进行估算。

然而就算基因组像Colossal所说的那样完整,且真的能够填补剩余空缺,目前仍没有可行方法生成包含该基因组的活细胞。因此,Colossal计划对一种现存的有袋动物——脂尾袋鼬进行基因改造,使其更像袋狼。

“这更像是对某些特征的再创造。”Mármol-Sánchez说,“它将不是一种灭绝的动物,而是现代动物的一个相当奇特的改造版本,类似于我们对那些灭绝动物的想象。”

Colossal称,他们对培养的袋鼬细胞基因组进行了创纪录的300次基因编辑。目前所有的改变都是小范围的,但Pask表示,团队计划在不久的将来更换成千上万的袋狼DNA碱基对。目前尚不清楚需要进行多少次编辑才能实现公司复生袋狼的目标。(杜珊妮)

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