DNA信息存储编解码新方案实现影像数据三维重建

DNA信息存储编解码新方案实现影像数据三维重建
2024年10月11日 06:00 中国科学报

本报讯(记者陈彬 通讯员赵晖)近日,天津大学合成生物学研究团队与天津市环湖医院合作,提出了一种DNA信息存储编解码新方案——“DNA Palette”。通过体外存储实验,该方案成功将患者疾病全周期的脑部核磁共振影像数据编码至DNA,并无损解码,实现影像数据的三维重建和病理诊断,为医疗数据存储技术提供了新解决方案。相关成果发表于《国家科学评论》。

脑部核磁共振检查在临床诊断、手术规划及疗效评估中具有重要价值,其生成的海量数据需要长期稳定地存储。尤其是青少年型帕金森病、癫痫和神经系统遗传病等疾病,影像数据需要从青少年时期开始积累,并在患者整个生命周期中持续存储和对比分析。如此大规模、长周期的数据存储对现有技术提出了严峻挑战。DNA作为一种极具稳定性和高存储密度的介质,被天津大学合成生物学研究团队验证可以成为满足长期数据存储需求的优质介质。

“DNA Palette”是针对脑部核磁共振数据特征而设计的创新编解码方案,展现出较高的适配性和实用性。研究团队将11.28兆字节的临床脑部核磁共振影像数据编码为约25万条DNA序列,净信息密度达到2.39比特每碱基。该方案在具备压缩效果的同时,避免了数据压缩算法的错误敏感问题,在测序覆盖度为2x和3x时也能够恢复尽可能多的信息,并在低于大多数现有研究的平均测序覆盖度(4.4x)下,实现原始数据的无损恢复。这些DNA以干粉形式稳定存储,质量仅为3微克,可支撑超过300次依据当前技术标准的读取操作。

据介绍,这项研究是天津大学合成生物学研究团队推动DNA信息存储技术实用化和应用化的重要探索,将为未来医疗数据的安全、高效存储提供新的技术路径,加速DNA存储技术的广泛应用。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1093/nsr/nwae321

DNA天津大学
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