北京时间2024年8月27日,上海大学医学院卞月珉教授与美国哈佛大学医学院Jonathan Abraham教授团队合作,作为共同第一作者,在国际顶级期刊《Cell》(《细胞》)上发表题为《Viral DNA polymerase structures reveal mechanisms of antiviral drug resistance》的研究论文。
DNA聚合酶是一类重要的药物靶标,系列结构研究捕捉到了其构象的多样性。然而,聚合酶的动态构象对药物抗性的影响,仍是困扰人们的一大问题。上述研究首次揭示了多种构象下与DNA结合的单纯疱疹病毒聚合酶全酶(DNA-bound herpes simplex virus polymerase holoenzyme),以及其与临床使用的抗病毒药物的相互作用。
相关工作直观展示了催化亚基Pol和过程因子UL42如何结合DNA以促进持续的DNA合成。值得指出的是,在没有引入核苷酸的情况下,Pol处于多种构象中,手指域处于闭合状态;而与药物结合的结构揭示了抗病毒药物对处于闭合构象聚合酶的亲和力与选择性。此外,分子动力学模拟和抗药性突变体的冷冻电子显微镜结构表明,相关抗性突变是通过调节构象动态以实现对药-靶相互作用的阻碍,而不是直接影响药物结合,从而阐明了导致药物选择性的机制。
澎湃新闻(www.thepaper.cn)记者从上海大学方面了解到,卞月珉为上海大学教授、博士生导师、上海市海外高层次人才。他本科毕业于中国药科大学,博士毕业于美国匹兹堡大学,曾担任资深计算科学家职位,就职于美国麻省理工和哈佛大学布罗德研究所从事新药研发工作,2024年3月全职加入上海大学医学院。他长期致力于人工智能药物发现相关研究,通过开发并整合机器学习与深度学习算法,计算化学与计算生物学策略手段,加速临床前早期药物发现。此外,他还担任了英国国家研究与创新署UKRI、智利国家研究与发展署ANID等机构的基金评审外籍专家,近五年,其代表性成果分别发表于《Nature》(《自然》)《Cell》(《细胞》)等顶级学术期刊。
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