推出全球首个深海多组学资源平台

本报讯（记者朱汉斌）南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）副主任钱培元团队携手香港科技大学海洋科学系教授吴龙君团队，推出全球首个深海多组学资源平台——DOO数据库。该数据库自正式上线以来，已吸引来自28个国家的900多次访问。相关成果近日发表于《核酸研究》。

据介绍，作为国际首个且规模最大的深海动物多组学数据库，DOO数据库致力于构建一个集多组学数据整合、定制化分析工具提供、跨物种比较与进化研究支持于一体的一站式平台，推动深海生物学、极端环境适应机制及深海生物资源的研究与应用。

研究团队收集并整合了68个深海动物的丰富多组学资源，包括72个基因组资源、950个转录组、1112个宏基因组及15个单细胞转录组。这些资源涵盖软体动物、环节动物、节肢动物、脊索动物、刺胞动物和棘皮动物等门类，覆盖了冷泉、热液喷口和海山等特殊深海生境类型。研究团队还整合了1413条古生物化石记录，为从演化生物学角度解析深海生物的环境适应策略提供支持。

DOO数据库集成了多个功能强大的模块。其中，基因与基因组模块涵盖了基因结构和功能注释、转录因子、泛素家族、转座子、基因家族等多个方面，为深入研究基因特征提供支持；功能基因组分析模块包含基因共表达网络、动态网络可视化、单细胞图谱可视化和宏基因组等功能，有助于揭示基因之间的相互作用和功能机制；进化与比较基因组模块则具备深海动物间微观和宏观共线性分析、祖先核型重建和进化树构建等功能，为探索深海生物的进化历程提供工具。

相关论文信息：https://doi.org/10.1093/nar/gkaf1096