随着科学技术的飞速发展,质谱仪的性能不断提升,新技术的突破层出不穷,精准、智能化蛋白质组学步伐也在不断加快。靶向蛋白质组学技术作为精准靶向的攻坚技术,在蛋白质组学的发展中不断更新。
诺禾致源创新性推出iPRM靶向蛋白质组技术。这项技术结合了高分辨率质谱技术和智能数据处理,旨在为科研工作者提供更加精准、高效的蛋白质组学解决方案。
1. iPRM靶向蛋白质组的简介
PRM(平行反应监测,Parallel Reaction Monitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的靶向蛋白质组学技术,能够对目标肽段进行选择性检测,从而实现对目标肽段/蛋白质的相对或绝对定量。使用传统的PRM靶向蛋白组技术,单次靶向验证目标蛋白的通量为30-50个蛋白。
iPRM(智能化平行反应监测,Intelligent Parallel Reaction Monitoring)是诺禾致源首创性研发的PRM靶向蛋白质组的升级技术,该技术智能化处理Astral DIA数据,无需人工矫正去除干扰碎片离子、无需手动调整Skyline软件的峰面积边界积分,极大的提高了蛋白质组的下机数据靶向验证的准确性,缩短了PRM靶向蛋白质组的单次实验的验证时间,突破性地实现靶向验证通量10倍的提高。
2. iPRM靶向蛋白质组的技术路线
该技术主要应用目标蛋白的验证上,技术流程包括样本蛋白提取、蛋白酶解、iPRM质谱检测、数据智慧化处理、数据分析与展示。
3. iPRM产品优势
01
目标蛋白超高检出
iPRM靶向蛋白组技术显著提高多肽和蛋白的鉴定数,一次实验可验证300个目标蛋白,目标蛋白的检出率可超过90%。在大型队列研究或复杂生物样本分析中,高通量验证可缩短实验周期(等于300次WB的验证),减少成本,同时保证了数据的全面性和代表性[1]。
02
目标蛋白检出高再现性
iPRM靶向蛋白质组,目标蛋白的检出样本之间变异系数(CV)值极低,一次验证300个目标蛋白,变异系数(CV)中值是0.04。通常低变异系数(CV)表示实验结果的一致性高,这对于药物靶点验证和生物标志物发现尤为重要[2]。
03
目标蛋白检出高精准定量
对于多种混合比的小鼠蛋白质组、大肠杆菌蛋白质组和拟南芥蛋白质组混合物,iPRM靶向蛋白质组技术能够精确测定每种目标蛋白质组的比例。在这项基准真值实验中,不同样品混合物的实测比例与其预期比例的比较结果表明,iPRM靶向蛋白质组技术在目标验证300个目标蛋白的检出上,可在较高的蛋白质强度动态范围内精准地检测 9 甚至是 2 的混合比,一次性验证300个蛋白的定量准确性更是在93%。
4. iPRM靶向蛋白质组的应用场景
疾病机制研究:应用于多种疾病研究,如炎症、肿瘤等,为科研提供精准的数据支持。靶向蛋白质组学在疾病研究中具有重要应用价值,能够提供高精准度的数据。在COVID-19 的背景下,靶向蛋白质组学方法已被用于高特异性和灵敏度检测SARS-CoV-2 肽,凸显了其在开发诊断和治疗策略方面的潜力[3]。
药物靶点验证:通过高通量、高准确性的靶向蛋白质组技术准确地测量药物与靶蛋白之间的相互作用,从而评估药物的效果和安全性验证药物靶点,提高药物开发效率[4]。
临床诊断与生物标志物发现:利用iPRM的高灵敏度和高重复性,发现和验证临床诊断标志物,推动精准医疗的发展。预将在生物标志物发现和临床诊断中具有显著优势,靶向蛋白质组能够推动精准医疗的发展[5]。
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