新疆对重大科技项目实行监理制，以提高项目管理的效率，增加项目执行的透明度，有效地将项目的决策、执行、管理、监督工作分离，打破了过去决策、管理、验收、评奖都由一个单位执行的历史，从而确保了项目从决策到评奖的公开、公正和透明。目前，新疆已对国家4个国家科技支撑计划项目及7个自治区科技重大专项管理实行了监理制。