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台湾学者表示，岛内河川遭受土石流、山坡地滥垦滥伐、河川水泥化等威胁，已严重影响到台湾岛独有的鱼种生存危机。台湾“中研院”指出，台湾长期忽略生态环保工程的结果，是近十年内已有六种鱼类在地球上消失，且此刻正有九种鱼类濒临消失中。“中研院”生物多样性研究中心代主任邵广昭表示，搜寻全球鱼类数据库，可得知台湾约有2775种鱼类，其中78种是台湾所独有的，全球没有其他地区可以找得到，但不过才短短十年，台湾就已经有六种鱼类“彻彻底底地”消失在地球上。邵广昭表示，近几年在台湾被发现的“新”鱼类
虽然数量增加快速，但新鱼种增加的速度并不代表台湾的鱼类资源就很丰富。因为，过度渔获、栖地破坏、污染及外来物种等原因，已经让台湾香鱼、大鳞细鱼扁、锐头银鱼、吻棘鳅、杨氏羽衣鲨等六种鱼类灭亡。邵广昭说，这些鱼多是河口淡水鱼。其中，台湾下鱼箴三十多年前曾在淡水河被发现外，但1969年以后即不曾再见到标本，而台湾当年这个“硕果仅存”的惟一标本，也外借到其他地方，迄今尚未归还。另外，原本生存在台岛北部的原生种台湾香鱼，可能与日本的鱼种不同，因鱼鳞较大，敌不过外来的日本香鱼，目前要看到台湾香鱼，也只能到博物馆去观赏标本。邵广昭指出，台湾香鱼最后出现的地方在双溪，现在台湾河川看到的全是来自日本的种类。台湾海洋大学海洋生物研究所陈义雄博士指出，近十年内栖地在狭分布的台湾独有鱼类，估算此刻正有九种濒临绝种当中，包括台湾鳟、中间鳅、台湾白鱼、南台中华爬岩鳅等。陈义雄表示，台湾土石流问题不解决，对这些狭分布鱼类冲击相当大。
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