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上市公司重组必然涉及目标公司的主管部门和该地区的政府相关机构。主管部门包括业务主管部门、行业主管部门以及国有资产主管部门；政府相关机构包括体改机构、经贸管理机构、证券管理机构、财政管理机构等。从本质上讲，主管部门和政府相关机构均是政府性质，均行使政府的相关职能。围绕目标公司的重组工作，离不开上述诸部门和机构的大力支持和指导，在行政程序上须履行逐级上报审批手续，涉及资产置换以及股权转让，还须先行取得有权机构和部门的审查和批准，方可实施。因此，上市公司资产重组工作与政府及其相
关机构密切相关，其作用和影响非常关键。
由于我国现阶段上市公司仍以国有或国有控股为主体，所以，上市公司的控股股东绝大多数为国有资产管理局或国有资产经营管理公司等“国”字头单位。因而，各级政府对在其所辖区内或拥有产权（股权）关系的各类上市公司的资产重组和股权转让等并购方面的工作，往往具有重要或关键作用。
综观近几年来我国上市公司并购案例的实况，发现政府所起的作用力往往表现为正、反两方面。在上市公司并购中政府所起的正作用力比较明显，一般表现为设立“上市公司重组工作小组”等类似领导机构来统一指挥协调，目前采用类似方式的有山东省、上海市、深圳市、云南省、四川省等省市地区。从实施情况看，上述省区内的上市公司并购进行的比较有效率，基本达到了整合行业、充分发挥上市公司“壳”资源的初级目标。在上市公司并购中政府正作用力虽收到明显效果，但作用力是有限度的，所以说也只能完成上市公司并购的初级目标。
鉴于政府“公权力”的特性和政府作用的两面性实际，要做好上市公司并购，必须发挥政府和上市公司并购各方两个方面的积极性。
一方面，要发挥政府方面的积极性。在这方面，除应对政府“公权力”进行合规性引导，以免权力运用时泛滥外，还应对政府“公权力”注入新鲜内容，如，注入商业法则方面的资本运作规则内容、股权收购操作规则内容、上市公司规范运作和法人治理规范内容、上市公司信息披露规范内容等，使政府“公权力”具有行政权力特质内容外，还具有商业法则的内涵，在一定程度上保障政府发挥正作用力，最大限度避免政府产生反作用力。当然，这只能解决在技术方面上的正、反作用力的问题。
另一方面，要发挥上市公司并购各方当事主体的积极性。上市公司并购各方当事主体包括重组方、原控股方、上市公司、上述各主体的相关公司或一致行动人（公司）等。这方面的积极性除继续按照商业法则运作外，还须充分重视运用政府“公权力”机制，对政府作用具有充分准确的认识。
应当说，在上市公司并购中，政府所起的作用是不可替代也无法替代。为强化政府正作用力，政府相关部门及其负责人员，必须保持一种持续不断的学习态度，坚持开拓创新与时俱进，在上市公司并购方面，既要避免浪费现有的上市公司“壳”资源，还要充分调动利用上市公司“壳”资源，为整合行业和产业服务。政府的关注点应开始从“ST”类公司转移开来，逐渐投向那些虽非“ST”但上市几年来始终未具备再从二级市场再融资的条件和资格从而形成“壳化”现象的上市公司。目前，全国各省区的上市公司的“壳化”现象普遍，且呈日益漫延态势，必须借助政府的力量进行遏止，其中“并购”和“腾壳”方式比较为政府热衷采用。
上述政府部门和机构在重组工作中虽然没有重组方和目标公司必须具有的法律资格和条件之要求，但其推动重组的正作用力和阻碍重组的反作用力不容忽视。所以，重组工作对政府及其相关机构也提出了“审查严格、实质重组、支持到位、力争多赢”的工作要求。
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