1947年7月,任华北财经办事处副主任、中国人民银行筹备处主任。
1948年6月,任华北银行总经理。8月,任华北人民政府委员。9月,任华北人民政府党组干事会成员。
1949年10月任中国人民银行总经理。
1949年10月,任政务院财政经济委员会委员、中国人民银行行长(党组书记)。
1950年4月,兼任中国银行董事长。6月,兼任交通银行常务董事。
1952年5月,任中国国际贸易促进委员会主席(设立党组后兼任书记)。
从1954年9月始,当选第一、第二、第三届全国人民代表大会常务委员会委员。
1966年,在“文化大革命”中遭残酷迫害。
1967年1月27日,含冤逝世。
1979年1月24日,中共中央举行隆重追悼会,为南汉宸彻底平反昭雪。党和国家领导人邓小平等同志参加了追悼会。中共中央的悼词对南汉宸作了高度的评价。
抗日战争胜利后,中央派南汉宸去张家口,任晋察冀边区政府财政处处长,领导晋察冀边区的财政工作,迎接华北的解放。1947年,应董必武邀请,南汉宸到河北平山,任中共中央工委财委副主任,后又调任华北财经办事处副主任,华北银行总经理。期间,他为统一华北、西北、华东和东北等解放区的财政、经济和货币,支援人民解放战争的胜利发展,做了大量的工作。在统一货币的过程中,工委组织了一个专门小组,筹备人民币发行事宜。南汉宸带领这个小组,克服重重困难,胜利完成了这一具有划时代意义的光荣任务。
1948年12月1日,中国人民银行成立,南汉宸被任命为中国人民银行行长。从这时起,直至建国初期,他以主要精力投身于建立新中国金融体系的伟大事业中,主要进行了以下三方面的工作:一是把各根据地银行都统一为人民银行,六大区成立区行,各省市成立分行,地区设支行。另外还建立了各种专业银行,如农民银行、交通银行、建设银行,加上农村信用合作社,构成一个完整的体系。二是接收国民党官僚资本的金融事业。在军管会领导下接收国民党的各个省银行,对民族资本家的银行、钱庄则采用接管并加以改造的办法。三是保持原中国银行的编制和名称,先行改造。
1950年8月1日,在南汉宸主持下,全国金融业联席会议在北京召开。会议根据中央调整工商业的方针,研究调整了金融业中的公私关系,金融业与工商业关系,以及金融业内部的劳资关系。经过这次调整,不仅帮助私营银行克服了困难,而且引导其开始走上国家资本主义道路。在以后的资本主义工商业社会改造中,南汉宸坚决贯彻党的方针、政策,使全国金融系统生产资料所有制的社会主义改造,到1952年12月提前完成,成为全国最先完成改造任务的行业。
我国第一套人民币上的“中国人民银行”是董必武写的,但至今仍在使用的人民币上的这五个字是谁写的却很少有人知道。原来,南汉宸平素喜欢书法,在考虑第二套人民币的字样时,他获悉银行员工马文蔚隶书写得好,便以试笔为名,大胆启用一个普通工作人员书写的“中国人民银行”及圆、角、分等几个字,这些字一直沿用至今。第二套人民币的设计经周恩来总理反复提出修改意见,经中央批准后,于1955年正式兑换发行。
关于人民币还有一个故事。1947年12月,时任中国人民银行筹备处主任的南汉宸到西柏坡请董必武书写了“中国人民银行”行名及人民币的票额数字。当时,华北财经办事处按照国际惯例,拟在票面上印毛主席像,毛主席不同意,说票子是政府发行的,不是党发行的;现在我是党的主席,而不是政府的主席,因此票子上不能印我的像,将来再说吧。
1952年,南汉宸着手筹划第二套人民币的发行,当时还处于保密阶段。一次,南汉宸在中南海开会时当面请示毛泽东:“您现在是中央人民政府的主席了,在第二版人民币的票子上可以印上您的像了吧?”毛主席说:“政府主席嘛是当上了,但当上主席还是不能印。因为进城前,我们在七届二中全会上作的决议,禁止用领导人的名字作地名、城市名、街道名和建筑物的名字,所以当上政府主席也不能印了。”