在董事会制度建设和运行方面，南京银行有两点鲜明的特色。其一，根据监管规定并结合自身公司治理的要求，制定了《董事履职评价办法》，并在实际运行中，对董事进行严格考核评价，体现了公开、公平和公正原则，提高了董事履职的积极性和创新性。其二，实行了《董事会履职自评价报告》制度，对年度董事会在公司治理、发展战略、资本管理、风险管理、审计监督等方面进行全方位评价，并针对不足，提出下年度的改进计划，使公司治理由“形”向“神”迈进。

　　公司董事会秘书在履职过程中进行了一些创新。(1)、制度创新：根据公司治理要求，建议实行了《高级管理层信息报告制度》，使得向董事会报告的事项及时、有序、完整，提高了董事会决策效率。(2)、组织创新：一是，为便于董事安排好自身工作，积极参加股东大会、董事会会议和专门委员会会议，建议实行了年度的会议预安排制度，使董事们能充分准备提案和建议；二是，针对部分异地独立董事和股东董事的情形，推动实行了对专门委员会会议实行时间优化集中模式，既提高了委员的议事决策效率，也减少了不必要的会议成本。(3)、沟通创新：主要是促进了各专门委员会与经营层相关部门的对口指导和沟通，较好地解决了内部人控制问题。