吴敬琏是经济体制改革研究的开创者之一。他在国内最早提出并倡导市场经济理论，是我国经济理论界“市场经济论”和“整体改革论”的主要代表人物，以坚持市场化改革而被称为“吴市场”。其不同时期的理论主张和政策建议，如建设市场经济、建立现代公司制度、国有企业战略性改组、大力发展中小企业等，在理论上始终一贯，在实践上推动了中国改革事业的前进。

　　吴敬琏近些年来对中国的发展模式和发展战略进行了深入研究，他通过分析、比较不同增长方式和理论，强调了效率提高对于经济增长的意义重于投入增加，进而对中国当前“片面重化工业化”的倾向提出批评。他指出，中国发展重化工制造业正面临许多问题，如土地不足、环境污染、能源消耗以及水资源不足等，因此，中国不可能再走“传统工业化”的道路，必须走新型工业化的道路，而不是过分依赖制造业尤其是重化工制造业。

　　他撰写的《中国增长模式抉择》(上海远东出版社，2006年)为获奖论著。该书总结了发展经济学中有关增长问题的理论演进，归纳了现代经济增长效率提高的主要源泉，讨论了中国增长模式和工业化道路存在的问题，论证了中国增长模式转换的必要性和切实可行路径，为中国走新型工业化道路和政府职能转变提供了理论基础，对中国新型工业化战略决策具有重要影响。

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