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2005年8月下旬至2006年1月下旬，审计署分两个阶段对国家人口计生委进行了经济责任审计和2005年度预算执行审计。审计期间，国家人口计生委积极配合，真实、完整、及时地提供相关资料，保证了审计工作顺利进行。针对这次审计发现的问题，国家人口计生委党组召开专题会议，认真研究，并提出了四项整改措施，责成有关部门逐项落实。
一是加强制度建设，强化预算管理。该委制定和完善《人口计生委预算管理办法》
、《农村基层计划生育服务体系建设项目管理办法》、《计划生育避孕药具专项经费管理办法》、《人口计生委国际援助项目资金管理办法》、《人口计生委国有资产管理办法》等规章制度，以强化预算约束，规范资金使用，加强财务监管，提高资金使用效率。
二是加强基础工作，全面提高财务管理水平。该委根据财政部政府收支分类改革和国库集中支付的要求，充实调整财务管理部门，重新划分财务人员的岗位职责，规范预算、决算编制和会计核算各项工作流程，制定标准化工作细则。
三是加强调查研究，积极推进专项经费和国有资产管理体制改革。该委集中组织了对历年来中央本级财政专项资金使用和管理情况的全面清查，并将会同有关部门对计划生育避孕药具专项经费、中央补助地方计划生育事业专项经费的分配和使用管理体制进行调研，从体制和制度方面解决财政专项经费管理使用中存在的突出问题；根据国家国有资产管理的有关法规，强化委机关和直属单位国有资产管理工作，重点解决对外投资管理中的问题；督促有关直属单位做好有关经费托欠账款历史遗留问题的清理工作。
四是加强能力建设，造就一支思想好、作风正、善管理的专业队伍。该委分期分批组织系统的财务人员进行培训，努力提高财务人员的政策水平、理论素养，增强业务操作能力、综合研究能力和沟通协调能力，拓宽财会专业人员的管理视野和管理水平。(张汉湘)
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