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2006年1月21日，上海医工院召开全体党员大会，大会是落实保持共产党员先进性长效机制的重要措施之一，目的在于进一步拓宽党员参政议政的渠道，落实党员的知情权和监督权，完善党内情况通报制度、情况意见反映制度、重大决策征求意见制度，使党员能“早知道、早讨论、早行动”。
上海医工院院长、党委书记朱宝泉在会上报告了2005年上海医工院的总体形势及20
06年工作安排，并传达了全国科学技术大会及上海“两会”的精神。在过去的一年里，上海医工院按照中央“树立和落实科学发展观”的要求，认真贯彻国务院国资委的工作部署，紧密依靠全院干部职工的团结奋斗，在技术创新上出成绩，在产业发展上出实效，在强化管理上出新意，在环境优化上下功夫，取得了良好业绩，不仅全面超额完成年度经济目标，产学研联动互动的发展格局也初步形成，企业综合实力、市场竞争力进一步提升。2006年上海医工院仍将坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面贯彻落实全国科学大会精神，建设创新型企业，以加快“产学研一体化的科技型医药企业集团、国家医药行业的科技创新基地”建设为目标，强化具有自主知识产权新药的研制，推动骨干公司的快速成长和现代企业制度的完善，探索建立研究生教育、人力资源培植的新机制，增强企业集团的控制力和风险防范能力，建设良好的企业文化和企业品牌，加强党建和思想政治工作，提升全院员工创新能力，确保医工院的持续健康发展。
党委副书记李炳生通报了党委2005年工作总结及2006年工作要点，他强调党的工作要紧密围绕经济建设这个中心、服务于创新发展的大局，起到凝聚人心、鼓舞干劲、树立榜样的作用，为实现医工院的改革发展提供坚强的思想政治保证。去年上海医工院开展的保持共产党员先进性主题教育活动，以“两促进，两不误”为要求，以“党员联线、支部联建、工学联系、党群联心，促进医工院各项工作”为主题，以建设群众满意度工程为目的，有力地保证了各项经济工作的开展，使医工院的经济实力和企业运行水平有了新提升，超额完成国资委确定的年度利润目标。2006年是“十一五”规划的起步之年，院党委要在国务院国资委党委和上海市经济工作党委的领导下，深入贯彻落实“三个代表”重要思想，树立科学发展观，切实履行好工作职责，规划要立意高远，机制要不断完善，安排要结合实际，过程要强化服务，推进要力求实效，同时在党的工作格局和党务干部队伍建设上，都要有新的调整和新的提高，不断开拓党建工作的新局面。
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